Die Ozontherapie spielt neben den Routinebehandlungen, die sich oft unterscheiden, eine Rolle in der komplementären Schnittführung. Manchmal kann sie auch zum Schutz vor den Nebenwirkungen anderer Behandlungsmethoden (z. B. Krebsbehandlungen) eingesetzt werden.
Wenn wir die Krankheiten auflisten, die am meisten von Ozonanwendungen profitieren: Die Ozontherapie ist äußerst wirksam bei Hautwunden, Druckgeschwüren, Verbrennungen, diabetischen Füßen, Knochenentzündungen (Osteomyelitis), Mundgeschwüren, chronischer Müdigkeit, Fibromyalgie und arthritisbedingten Erkrankungen, Schmerzen und neuropathischen Schmerzen. Zusätzlich zu dieser Vielzahl von Behandlungen, die bei der Krebsbehandlung eingesetzt werden, wird die Ozontherapie häufig bevorzugt. Ihre Vorteile werden in der Unterstützung des Immunsystems, der Beschleunigung der Reparatur und Regeneration von beschädigtem normalem Gewebe und der Beseitigung von freien Radikalen gesehen, die nach Veränderungen auftreten.
Die Verfahren werden auch zur Behandlung von Immunkrankheiten wie Multipler Sklerose, rheumatoider Arthritis, Morbus Crohn sowie von chronischen Krankheiten und chronischen Lungenerkrankungen, Asthma und Allergien eingesetzt. Aufgrund seiner Anti-Aging- und antioxidativen Eigenschaften wird Ozon im Rahmen der präventiven Behandlung von gesunden Personen eingesetzt.